Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnajb6O54946 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb6O54946 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms