Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CrxO54751 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CrxO54751 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CrxO54751 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CrxO54751 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CrxO54751 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CrxO54751 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CrxO54751 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CrxO54751 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CrxO54751 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CrxO54751 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CrxO54751 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CrxO54751 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CrxO54751 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CrxO54751 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CrxO54751 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CrxO54751 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CrxO54751 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CrxO54751 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CrxO54751 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CrxO54751 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CrxO54751 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CrxO54751 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CrxO54751 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms