Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Sp100O35892 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Sp100O35892 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sp100O35892 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Sp100O35892 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sp100O35892 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sp100O35892 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Sp100O35892 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sp100O35892 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Sp100O35892 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Sp100O35892 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Sp100O35892 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sp100O35892 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sp100O35892 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Sp100O35892 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sp100O35892 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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