Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stag2O35638 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Stag2O35638 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stag2O35638 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Stag2O35638 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stag2O35638 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stag2O35638 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stag2O35638 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stag2O35638 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stag2O35638 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stag2O35638 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stag2O35638 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms