Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms