Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ArxO35085 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ArxO35085 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ArxO35085 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ArxO35085 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ArxO35085 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ArxO35085 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ArxO35085 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ArxO35085 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ArxO35085 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ArxO35085 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ArxO35085 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ArxO35085 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ArxO35085 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ArxO35085 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ArxO35085 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ArxO35085 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ArxO35085 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ArxO35085 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ArxO35085 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ArxO35085 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ArxO35085 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ArxO35085 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ArxO35085 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ArxO35085 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ArxO35085 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ArxO35085 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ArxO35085 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ArxO35085 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ArxO35085 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ArxO35085 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ArxO35085 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ArxO35085 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArxO35085 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms