Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap23O09044 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap23O09044 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap23O09044 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap23O09044 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap23O09044 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms