Protein–RNA interactions for Protein: O08638

Myh11, Myosin-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh11O08638 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myh11O08638 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myh11O08638 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myh11O08638 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myh11O08638 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Myh11O08638 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms