Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms