Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gm3239L7N2D9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gm3239L7N2D9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gm3239L7N2D9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gm3239L7N2D9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gm3239L7N2D9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gm3239L7N2D9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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