Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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