Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm5294J3QP53 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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