Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm21900J3QP38 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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