Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Gm17577J3QNF7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Gm17577J3QNF7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Gm17577J3QNF7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Gm17577J3QNF7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Gm17577J3QNF7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Gm17577J3QNF7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Gm17577J3QNF7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm17577J3QNF7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
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