Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms