Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Top6blJ3QMY9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Top6blJ3QMY9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Top6blJ3QMY9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Top6blJ3QMY9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Top6blJ3QMY9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Top6blJ3QMY9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Top6blJ3QMY9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Top6blJ3QMY9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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