Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3336J3QMQ6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3336J3QMQ6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3336J3QMQ6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3336J3QMQ6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3336J3QMQ6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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