Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmem200cJ3QK46 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms