Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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