Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HrcG5E8J6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HrcG5E8J6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HrcG5E8J6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HrcG5E8J6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HrcG5E8J6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms