Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms