Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms