Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Farp1F8VPU2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms