Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm10378F6XQQ1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm10378F6XQQ1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm10378F6XQQ1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Gm10378F6XQQ1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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