Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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