Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rdh16f1E9Q9P8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rdh16f1E9Q9P8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rdh16f1E9Q9P8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rdh16f1E9Q9P8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rdh16f1E9Q9P8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rdh16f1E9Q9P8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Rdh16f1E9Q9P8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rdh16f1E9Q9P8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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