Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC005561E9Q5E2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BC005561E9Q5E2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms