Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Gm17727E9Q4V7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Gm17727E9Q4V7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Gm17727E9Q4V7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm17727E9Q4V7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Gm17727E9Q4V7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Gm17727E9Q4V7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Gm17727E9Q4V7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Gm17727E9Q4V7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17727E9Q4V7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms