Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gcom1E9PZ54 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms