Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms