Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim30bE9PVL6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim30bE9PVL6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms