Protein–RNA interactions for Protein: E9PUT9

Gm3252, Predicted gene 3252, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3252E9PUT9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3252E9PUT9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3252E9PUT9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms