Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

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Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc170D3YXL0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ccdc170D3YXL0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc170D3YXL0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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