Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rfx8D3YU81 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rfx8D3YU81 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Rfx8D3YU81 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfx8D3YU81 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Rfx8D3YU81 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Rfx8D3YU81 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Rfx8D3YU81 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rfx8D3YU81 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rfx8D3YU81 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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