Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Cttnbp2B9EJA2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms