Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Phf11bB4XVQ1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Phf11bB4XVQ1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Phf11bB4XVQ1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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Phf11bB4XVQ1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Phf11bB4XVQ1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Phf11bB4XVQ1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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Phf11bB4XVQ1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Phf11bB4XVQ1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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