Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cspp1B2RX88 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms