Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Siah3B2RWG3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms