Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rd3lB2RV38 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms