Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprbB2RU80 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms