Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Apol7aB2RT54 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apol7aB2RT54 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms