Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ssxb8B1AY40 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssxb8B1AY40 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ssxb8B1AY40 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ssxb8B1AY40 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ssxb8B1AY40 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb8B1AY40 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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