Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms