Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp36B1AQJ2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms