Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
H2-M5A7VMS3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms