Protein–RNA interactions for Protein: A2CE44

Zxdb, Zinc finger X-linked protein ZXDB, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZxdbA2CE44 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ZxdbA2CE44 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ZxdbA2CE44 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ZxdbA2CE44 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZxdbA2CE44 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZxdbA2CE44 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZxdbA2CE44 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZxdbA2CE44 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZxdbA2CE44 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZxdbA2CE44 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZxdbA2CE44 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZxdbA2CE44 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZxdbA2CE44 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZxdbA2CE44 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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ZxdbA2CE44 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZxdbA2CE44 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms