Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtf1A2AQ19 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms