Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms