Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramel3A2AHA7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms