Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms